超濾膜的清洗，又可分為物理清洗法和化學(xué)清洗法兩種。

　　一、物理清洗法：
在這方面用的多普遍的就是水力沖洗法。工業(yè)設(shè)備清洗廠家物體表面受到物理、化學(xué)或生物的作用而形成的污染層或覆蓋層稱作污垢，去除這些污染物或覆蓋層而使其恢復(fù)原表面狀況的過程稱為清洗。它又可因水力沖洗方向的不同，分為逆向沖洗、反沖洗和正洗沖洗。
逆向沖洗：
用原水沖洗膜內(nèi)和進水端面的雜質(zhì)。
反沖洗：
用超濾水從膜塊表面的污染物沖松散、剝落，分別從進水口和濃縮口排出（可加酸、堿或次氯酸鈉(Sodium)等藥品加強清洗效果）。
正洗沖洗：
用原水沖洗膜內(nèi)和端面的雜質(zhì)，按運行狀態(tài)將超濾膜清洗干凈。

　　二、化學(xué)清洗法：
根據(jù)膜表面污染物質(zhì)的種類，選擇適當(dāng)?shù)幕瘜W(xué)藥品與之進行溶解、氧(Oxygen)化或其他化學(xué)反應(yīng)(Chemical reaction)達到去除的目的。常用的化學(xué)藥品的選擇必須根據(jù)膜材料的性質(zhì)選擇，如酸類、堿類、氧化劑、殺菌劑(成分:無機化合物)、表面活性劑以及加酶洗滌(washing)劑等。進行方法與正常超濾過程相同，清洗液自原液入口處進入，濃縮液及超濾液全部返回清洗液容器，循環(huán)后排放，以凈水洗凈即可。
酸性清洗劑常用的有0.N鹽酸(HCl)溶液，0.M草酸(化學(xué)式:H2C2O4) 溶液，～3%檸檬酸、檸檬酸胺、EDTA等。這類清洗劑在去除鈣（Ca)離子、鎂離子、氟(fluorine)離子等金屬離子(metal ion)及其氫(Hydrogen)氧化（oxidation)物，無機鹽凝膠(gelate)層是較為有效的。
堿性清洗劑主要是0.～0.5%的NaOH水溶液。工業(yè)設(shè)備清洗廠家物體表面受到物理、化學(xué)或生物的作用而形成的污染層或覆蓋層稱作污垢，去除這些污染物或覆蓋層而使其恢復(fù)原表面狀況的過程稱為清洗。它對去除蛋白質(zhì)，油脂類的污染具有良好的效果。
氧化（oxidation)性清洗劑如～.5%雙氧水(aquae hydrogenii dioxidi)、0.5～%NaOC
　　
　　L、0.05～0.%疊氮酸鈉等，對去除有機物質(zhì)的污染有顯著效果。
生物酶(Enzyme)制劑如%胃蛋白酶、胰蛋白酶等，對去除蛋白質(zhì)(protein)、多糖、油脂類的污染是有效的。對去除有機物污染也有一定效果。應(yīng)用酶清洗劑時，如能在55～60℃下進行清洗效果更佳。清洗時間的長短與酶濃度的高低有關(guān)。
超濾膜在特定條件下采用化學(xué)清洗方法雖是必要，但使用時須慎重?；ぴO(shè)備清洗許多的水處理設(shè)備、設(shè)施（如冷卻水塔、冷水機組、水池等），長期運行后。都需要得到有效的清洗。清洗的目的是除去其系統(tǒng)中的污垢、腐蝕產(chǎn)物、微生物及其衍生物等，提高系統(tǒng)的工作效率。要避免化學(xué)清洗劑破壞膜的分離性能；不能使污染物發(fā)生變形，加重膜的污染；不應(yīng)破壞污染物的膠體性質(zhì)，使它變硬僵化。在食品工業(yè)，醫(yī)藥工業(yè)生產(chǎn)(Produce)中，不能讓清洗劑的殘留物影響產(chǎn)品質(zhì)量等。